Μια αποστολή ορειβατών ανακαλύπτει τυχαία τα ίχνη της Κιβωτoύ του Νώε η οποία κατέχει τη δύναμη να μετατρέψει τον κάτοχό της στο επίπεδο του Θεού ή ακόμα και να καταστρέψει ολόκληρη την ανθρωπότητα. Η ανακάλυψη αυτή κινεί το ενδιαφέρον δύο μυστικών οργανώσεων οι οποίες με σκοπό να αποκτήσουν την κιβωτό μετατρέπουν τη Γη σε πεδίο μάχης....

Δυο χρόνια έχουν περάσει από τότε που η ειρήνη επανηλθε και τα ερείπια της πόλης Μίντγκαρ στέκονται ως μνημείο των θυσιών που χρειάστηκαν για να τερματιστεί ο πόλεμος. Όμως μια νέα απειλή πλησιάζει όταν ένας μυστηριώδης ιός κάνει την εμφάνισή του σπέρνοντας το θάνατο... Καθώς οι παλιοί εχθροί επανέρχονται ο στρατιώτης Κλάουντ που είχε αποσυρθεί...